Nucleosomes ile ilgili faydalı notlar: Woodcock (1973)

Nucleosomes hakkında faydalı notlar!

Woodcock (1973), kromatinin, nükleozomlar olarak bilinen yinelenen vücut modelinden oluştuğunu göstermiştir. Nükleozomlar esas olarak DNA ve histon moleküllerinden oluşur.

Her ne kadar DNA molekülleri çok uzun olsa da, pozitif yüklü histonların daha küçük çaplarda yardımı ile doludur. Bu temel paketleme birimi nükleozom olarak bilinir (Şekil 6.7).

Bir proteinin yüklü yan zincirlere sahip amino asit kalıntılarının bolluğuna bağlı olarak şarj edilmesi gerekir. Histonlar lisin ve arginin bakımından zengindir (amino asit kalıntıları). Bu amino asitler yan zincirlerinde pozitif yük taşırlar.

Elektron mikroskobu altında, kromatinin çoğu 30 nm çapında bir fiber olarak görülür. Kromatin paketlemenin temel formu, genel olarak 30 nm kromatin lifi olarak bilinir. DNA molekülleri çok uzun olsa da, küçük çaplı histonların yardımı ile doludurlar. Bu temel paketleme birimi nükleozom olarak bilinir.

Nudeosomlar, kromatine, elektron mikroskobunda sicim üzerindeki boncuk (Şekil 6.7) görünümünü verir. Nükleozom tanecikleri, çapı yaklaşık 11 nm olan disk şeklindeki parçacıklar olarak görünür. Her bir nükleozom boncuk, 8 histon molekülü (oktamer) kopya hareketinden oluşur.

Bu yüksek oranda korunmuş nükleozomal histonların her biri, H2A, H2B, H3 ve H4 sayıca ikidir. Bu histonlar etrafına çift sarmallı DNA fragmanının (146 gevşek uzun çift) sarıldığı bir protein çekirdeği oluşturur. Histon oktamer ayrıca nu (v8) gövdesi olarak da adlandırılır. Her bir histon molekülü, bazik amino asitlere sahip olan yüksüz hidrofobik bölge ve yüklü bölge olmak üzere iki parçaya sahiptir.

DNA, nükleozomun histon oktamerinin üzerine, 1.75 dönüş oluşturan süperel (yüksek dereceli bir sarmal) halde sarılır (Şekil 6.11). DNA aynı zamanda nükleozomdan nükleozoma sürekli bir iplik halinde uzanır.

Her bir nükleozom boncuk, bir diğerinden yaklaşık olarak 60 baz çifti olan bir bağlayıcı DNA bölgesi ile ayrılır. Bağlayıcı DNA artı nükleozom boncuk, bu nedenle yaklaşık 200 baz çift DNA içeren tüm nükleozomu oluşturur.